Subtansi kajian mencakup potensi sumberdaya kelautan dan Perikanan sebagai daya tarik wisata di KKP Selat Pantar, kondisi eksisting kelembagaan dan program serta isu dan permasalahan dalam pengembangan pariwisata alam, konsep dan arahan pengembangan pariwisata alam perairan berkelanjutan, analisis model pengembangan yang mencakup penetapan klaster pengembangan dengan mempertimbangkan daya tarik wisata utama dan pendukung, pola perjalanan (travel pattern), estimasi penerimaan dan peluang investasi. Juga dipaparkan kebijakan, strategi dan program prioritas pengembagan pariwisata alam perairan berkelanjutan di KKP Selat Pantar yang diselaraskan dengan dokumen kebijakan makro yakni Rencana Induk Pengembangan Pariwisata di tingkat Provinsi NTT dan Kabupaten Alor.